دکتر فرهادی رئیس بخش و رئیس مرکز تحقیقات گوش و حلق و بینی و جراحی سر و گردن مجتمع بیمارستانی رسول اکرم (ص) است و داروی گیاهی «ضد ایدز» ایمود توسط گروه تحقیقاتی به‌ سرپرستی وی به موفقیت‌های چشمگیری دست یافت.

از جمله مهم‌ترین سوابق اجرایی فرهادی می‌توان به وزارت فرهنگ و آموزش عالی در فاصله سال‌های ۶۴ تا ۶۸ و وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی در دولت هفتم اشاره کرد.

وی مدتی نیز رئیس دانشگاه تهران، قائم‌مقام جمعیت هلال‌احمر در دوران دفاع مقدس، مشاور وزیر و دبیر شورای آموزش پزشکی کشور و رئیس صندوق حمایت از پژوهشگران کشور بوده است.

درحال حاضر ایشان وزیر محترم علوم، تحقیقات و فناوری در دولت یازدهم و عضو کابینه رئیس جمهور محترم جناب آقای دکتر حسن روحانی هستند.